桃驯化和育种的基因组印记
日前,明升官网农业明升体育app院郑州果树研究所研究员王力荣团队与华中农业大学教授郭文武、美国康奈尔大学Boyce Thompson研究所教授费章君合作完成基于480份桃全基因组重测序解析桃育种历史的研究成果,在线发表于《基因组生物学》。该研究采用目前最大规模的桃重测序,揭示了桃驯化和改良的基因组印记,阐明桃果实大小和风味性状的分子演化机制,为桃全基因组选择育种提供支撑。
桃起源于我国,种质资源丰富。该研究团队对480份野生和栽培桃样本进行全基因组重测序,涵盖国家桃种质圃(郑州)1410份种质95%以上的遗传多样性,构建了迄今为止世界上最大的桃变异组数据库。利用变异组数据,对11个重要农艺性状进行全基因组关联分析,发现多个新位点,为分子标记的开发和分子育种提供了材料。
野生桃经过驯化和改良阶段的进化,果实外观、大小和品种均发生剧烈变化。通过比较基因组学,该研究阐明桃驯化和改良中人工选择的基因组区段,揭示桃如何由野生状态进化成为现今栽培状态的分子机制。
研究发现,桃果实大小的增加主要发生在驯化阶段,而果实风味相关的位点在驯化和改良阶段均受到强烈选择作用,但改良阶段选择的位点数目更多;苦涩味相关位点在驯化中基本已经丢失。另外,该研究还鉴定了低需冷量育种的目标区段,发现东方、西方桃改良阶段约50%的受选择基因组区段不同,从基因组层面解析了需冷量、肉质和风味相关基因的演化规律。
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