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作者:高雅丽 甘晓 来源:明升官网明升体育app报 发布时间:2020/2/28 12:47:44
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源自国外?新冠病毒溯源深陷迷雾

 

2月27日,国家卫健委高级别专家组组长钟南山在手机版通气会上表示,疫情首先出现在明升官网,不一定是发源在明升官网。

同时,最新研究表明,继蛇、穿山甲、水貂之后,龟类也可能是新冠病毒的潜在中间宿主。

有关新冠病毒溯源的新进展源源不断。然而,它从哪里来?如何到达人类?又为什么是武汉?这些问题迄今没有答案,病毒溯源仍然深陷迷雾之中。

起点:打开蝙蝠的“潘多拉魔盒”

2019年12月31日,武汉卫健委发布公告证实,已发现27例与华南海鲜城有关联的病毒性肺炎病例。不久后,病原检测结果显示,这些病例源自一种未知的“新型冠状病毒”。

病原体的确定,吹响了追踪“疑犯”的号角。最先被明升体育app家追踪到的是病毒的起点——蝙蝠。2020年1月23日,中科院武汉病毒所石正丽团队在预印本网站BioRxiv在线发表论文,指出蝙蝠是最有可能携带新冠病毒的野生动物。2月3日,该文在线发表于《自然》杂志。

研究团队发现,与此前在云南中菊头蝠上检测到的蝙蝠冠状病毒RaTG13相比较,新冠病毒在整个基因组中与其有96.2%的一致性,与SARS冠状病毒有79.5%的一致性。同时,新冠病毒通过与人体内广泛分布的蛋白ACE2结合进入细胞,与当年非典病毒的“套路”如出一辙。[1]

这为蝙蝠是新冠病毒的天然宿主提供了强有力的证据,得到了明升体育app界广泛共识。

争议同时存在。新冠病毒能否直接从蝙蝠到人?1月31日,华盛顿大学生物信息学专家Trevor Bedford接受《明升体育app》采访时指出:“RaTG13序列与新冠病毒有近1100个核苷酸的差异。”基于此,专家们认为,这意味着它从蝙蝠到人之间还存在1个或多个中间宿主。

不过,据《第一财经》2月24日报道,美国瓦克斯曼微生物研究所所长Richard Ebright认为,从蝙蝠病毒到人感染的新型冠状病毒,可能不需要再有中间宿主。

石正丽团队2018年2月在Virologica Sinica(《明升官网病毒学:英文版》)上发表的一项实证研究也佐证了这一点。论文称,在对218名云南居民的采样调查中,有6人在SARS相关冠状病毒的检测中呈阳性。排除其他可能因素后,这项研究提供了蝙蝠SARS相关冠状病毒可能感染人类的首份血清学证据。[2]

打开蝙蝠的“潘多拉魔盒”后,有没有中间宿主、又是谁扮演了中间宿主的角色?

中间宿主:薛定谔的穿山甲

继SARS冠状病毒和MERS冠状病毒之后,新冠病毒是几十年来人畜共患型冠状病毒第三次跨物种感染人类。过去两次经验表明,确定中间宿主并不容易。

从蛇、水貂到穿山甲、龟类,新冠病毒中间宿主如同“薛定谔的猫”。有关新冠病毒中间宿主的研究中,穿山甲嫌疑最大。

2月7日,华南农业大学召开手机版发布会,宣布在穿山甲体内发现了β冠状病毒的序列,与目前感染人的毒株序列相似度高达99%,由此推测其是潜在中间宿主。[3]

研究团队随后提交的预印本论文显示,在全基因组层次上,穿山甲冠状病毒全组基因与人新冠病毒的同源性为90%。[4]论文作者将这一差异解释为“生物信息学小组和研究实验室之间令人尴尬的错误沟通”。[5]

论文最令人振奋的结论是,在最为关键的刺突蛋白受体结合域上,穿山甲冠状病毒与新冠病毒仅有一个氨基酸不同。

来自学界的质疑则认为,穿山甲样本的来源至关重要。“目前尚不清楚宏基因组样品来自饲养场所还是野外,如果1000份穿山甲样品仅来自一个特殊的群体,则没有代表性。”中科院动物所研究员蒋志刚对《明升官网明升体育app报》表示。[7]

2月21日,香港大学教授管轶团队提交的预印本论文佐证了这一结论。他们在走私穿山甲组织样品中发现冠状病毒,受体结合域的氨基酸序列与人新冠病毒相似性高达97.4%。[6]

另一项研究得到了截然不同的结论。广东省生物资源应用研究所教授陈金平团队分析,尽管穿山甲冠状病毒与新冠病毒、蝙蝠冠状病毒都有遗传相关性,但我们不清楚这种穿山甲携带冠状病毒的人畜共患情况,所以不能直接证明穿山甲就是新冠病毒的中间宿主。[8]

此前,陈金平团队曾在Viruses发表论文,揭示了另一批走私的马来穿山甲被冠状病毒感染。[9]

美国贝勒明升手机版院Joe Petrosino研究团队则总结,在刺突蛋白的受体结合区域新冠病毒与穿山甲冠状病毒最像,在全基因组层面又与蝙蝠冠状病毒RaTG13最像。“这表明,新冠病毒的演化过程中,发生过不止一次的重组,穿山甲只是参与了其中的一环。”该团队2月13日在BioRxiv上发表的论文中称。[10]

2月26日,来自湖北明升手机版院附属人民医院刘龙联课题组等在《明升手机版病毒学杂志》上发表的论文指出,采用冠状病毒刺突蛋白和宿主ACE2受体的组成和差异,预测龟类(西部锦龟、绿海龟、中华鳖)也可能是新冠病毒传播给人类的潜在中间宿主。[11]

中山大学明升手机版院院长郭德银告诉《明升官网明升体育app报》:“对于新冠病毒从自然界中的某种宿主到中间宿主再到人,明升体育app虽然难以以一种重现的方式去证明,却可以用确凿的证据,以完备的逻辑形成证据链,去确证结果。

进攻人类:海鲜市场疑云待解

新冠病毒从野生动物跨物种进军人类的过程中,发生了什么?又是在哪里发生的?

分子层面的微观生物学研究是回答基础明升体育app问题的重要方法。2月21日,西湖大学研究人员利用冷冻电镜的,发现新冠病毒刺突蛋白像一座桥横跨在ACE2表面,又像病毒的一只手紧紧抓住ACE2。[12]

同时,基于测序结果的共识是,病毒一次性进入人体,然后进行人际传播。

国内一位病毒学家告诉《明升官网明升体育app报》:“目前正在传播中的病毒来源于同一个‘祖先’,传播路径可能是病毒从动物偶然传染给某一个特定的人,发生了变异,然后开始人际传播。所以,如果能找到最早发生感染的‘零号病人’,病毒源头就找到了。”

带着寻找“零号病人”的任务,流行病学家参与进来。当然,对他们而言,更有意义的是“指示病例(index case)”,指能够观察到的首个病例。

随着早期病例陆续披露,搜索目标锁定在华南海鲜市场。《明升官网手机版周刊》对武汉市中心医院急诊科主任艾芬的采访中提到,2019年12月18日该院接到首位病患为华南海鲜市场送货员。2019年12月27日,“疫情上报第一人”张继先上报第一批四位病人中,包含华南海鲜市场的一位商户。

另据明升官网疾控中心1月26日消息,从华南海鲜市场的585份环境样本中,检测到33份样品含有新型冠状病毒核酸。[13]

不过,也有越来越多的证据显示,此前的推测可能错了。武汉金银潭医院副院长黄朝林等1月24日在《柳叶刀》发表的论文显示,41个病例中只有27个病例有海鲜市场的暴露史。特别是,2019年12月1日发病的首名患者没有海鲜市场暴露史,12月10日发病的三人中有两人也与海鲜市场无关。[14]

2月26日,“武汉发布”微博公布,武汉市登记手机版最早的新冠肺炎患者为陈某,发病时间为2019年12月8日,否认去过华南海鲜市场。

海鲜市场只在早期疫情发挥了“推波助澜”的作用。2月20日,明升官网明升体育app院西双版纳热带植物园发布的研究为这一结论提供了数据支持。

这项研究分析了现有数据库中93个病毒样本中的58种单倍型,以了解不同病毒样本的演化关系。结果显示,与蝙蝠冠状病毒紧密关联的“祖辈”,和华南海鲜市场的“孙辈”没有亲缘关系。研究人员据此推断,华南海鲜市场的新冠病毒是从其它地方传入,再在市场发生快速传播并蔓延。[15]

从蝙蝠到穿山甲,再到华南海鲜市场,新冠病毒源头和传播路径仍然扑朔迷离,一切假设和推断尚需时间和研究工作去证实。

参考文献:

[1] http://www.nature.com/articles/s41586-020-2012-7

[2]http://www.virosin.org/en/article/doi/10.1007/s12250-018-0012-7

[3] http://www.scau.edu.cn/2020/0208/c1302a219376/page.htm

[4] http://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.02.17.951335v1

[5] http://mp.weixin.qq.com/s/NVdljRXbuoTZ0EzybOKVrA

[6]http://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.02.13.945485v1

[7] http://mp.weixin.qq.com/s/vrFcp_B6JWhFKSekXMd9IA

[8] http://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.02.18.954628v1

[9] http://www.mdpi.com/1999-4915/11/11/979

[10] http://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.02.07.939207v1

[11] http://mp.weixin.qq.com/s/xPVg871X8V9VCbKOBWTo-g

[12] http://www.westlake.edu.cn/info/1017/4353.htm

[13] http://www.chinacdc.cn/yw_9324/202001/t20200127_211469.html

[14] http://www.caixin.com/2020-01-26/101508497.html

[15] http://mp.weixin.qq.com/s/eAsXMS13i7NGH-pXOt1Kaw

 
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