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作者:傅金钟等 来源:《BMC基因组学》 发布时间:2012-11-12 15:49:00
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推动两栖动物适应高海拔环境候选基因被发现

 成都生物所等发现推动两栖动物适应高海拔环境的候选基因
 
寻找生物适应高海拔环境的遗传机制是近年来明升m88明升体育app领域研究热点之一,然而已有大部分研究都是针对恒温动物,对于变温动物适应高海拔环境的遗传机制还很不清楚。与恒温动物相比,变温动物在生理和行为特征上都有诸多不同,这也暗示了它们在进化过程中可能有独特的适应高海拔环境的机制。  
 
为了探寻这一个问题,中科院成都生物研究所傅金钟课题组与美国加州大学伯克利分校Ke Bi博士合作,以青藏高原东缘的一对姐妹物种——低海拔的明升官网林蛙(Rana chensinensis)和高海拔的高原林蛙(Rana kukunoris)为研究对象,通过高通量的RNA-seq测序技术以及生物信息学的分析方法,组装并获得了7000对以上的直系同源(orthologous)基因,发现这些基因中有450个带有正选择标记(positive signature),并通过功能推断得到了14个可能与高原林蛙适应高海拔环境相关的候选基因,这些基因大多与抗紫外、抗低氧和新陈代谢调节等功能相关。
 
有趣的是,与恒温动物相比,高原林蛙CYP家族的基因同样经历了正选择,这暗示着恒温动物与冷血动物在氧结合(oxygen binding)功能上的趋同进化。以上研究结果,为进一步研究变温动物适应高海拔环境的遗传机制打下了基础。
 
该研究结果已于近期发表在基因组学刊物BMC Genomics上。 (来源:中科院成都生物研究所)
 
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