美国转化基因组研究院（TGen）的研究人员通过全基因组测序，在转移性三阴性乳腺癌（TNBC）中发现了之前未曾报道过的突变。这篇文章发表在近期的《Molecular Cancer Therapeutics》上。
三阴性乳腺癌是指雌激素受体（ER）、孕激素受体（PR）和人表皮生长因子受体（HER2）均呈阴性的一种特殊类型乳腺癌。在西方人群中，三阴性乳腺癌占全部乳腺癌的10%-15%，尤以非洲裔人群多见。来自亚洲的手机版显示，三阴性乳腺癌发病率为7%-19%，与白种人相差不多。这种疾病本身具有较高的侵袭性，术后复发转移风险高，且缺乏内分泌治疗，抗HER2靶向治疗的机会。
领导这一研究的是TGen的高级研究员、综合癌症基因组学部主任John Carpten。近年来，Carpten博士领导的研究小组利用新一代测序技术，对多个肿瘤开展了深入的基因组学图谱分析，包括前列腺癌、鼻咽癌、三阴性乳腺癌和结肠癌等。在这项研究中，Life Technologies公司也给予了支持。
研究小组利用Life Tech的SOLiD 4平台对来自不同族裔的转移性TNBC患者的14个肿瘤样本进行了分析，在十几个基因中发现了明显的突变及其他改变。这些肿瘤中突变最频繁的基因是TP53肿瘤抑制基因，14个肿瘤中的7个有突变。而在两名非洲裔美国人身上，也检测到另一个肿瘤抑制基因CTNNA1的异常。ERBB4基因也有改变，此基因参与了怀孕和哺乳期间的乳腺腺体成熟，但之前从未与转移性TNBC相关联。
研究还包含了“异常值分析”，评估了每个肿瘤的表达模式，并与研究中的其他肿瘤进行比较。在研究的队列人群中过表达的癌基因有：ALK, AR, ARAF, BRAF, FGFR2, GLI1, GLI2, HRAS, HSP90AA1, KRAS, MET, NOTCH2, NOTCH3和SHH。表达明显降低的癌基因有：BRCA1, BRCA2, CDKN2A, CTNNA1, DKK1, FBXW7, NF1, PTEN和SFN。
每个肿瘤在基因组上都是独特的，但在14个肿瘤中，有9个都包含了特定细胞通路的改变：RAS/RAF/MEK/ERK和PI3K/AKT/MTOR，有的是一条改变，有的是两条都改变。
作者认为，转移性TNBC的全基因组和转录组分析让人们深入了解了这种癌症的体细胞事件。这些基因组数据有望指导患者参与研究性的治疗试验，并为未来试验提供假设。
Life Technologies公司的首席医疗官Paul Billings博士表示：“研究强调了基因组测序在改善癌症治疗上的潜在临床价值。我们希望在不远的将来，更多患者和医生能够用到测序。基因组测序最终将成为肿瘤科医生的标准工具，让他们能够为每位患者度身定制疗法。”（来源：生物通 薄荷）
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