MBD7与IDM复合体抗沉默机制示意图
2月12日,国际权威学术期刊(Molecular Cell)在线发表了明升官网明升体育app院上海明升m88明升体育app研究院上海植物逆境生物学研究中心朱健康课题组的研究论文The Methyl-CpG-Binding Protein MBD7 Facilitates Active DNA Demethylation to Limit DNA Hyper-Methylation and Transcriptional Gene Silencing。该研究揭示了甲基化CpG结合蛋白MBD7通过促进DNA主动去甲基化,限制了DNA高度甲基化以及转录水平的基因沉默,MBD7和IDM2、IDM3以及IDM1形成抗沉默蛋白复合体,在DNA的主动去甲基化过程中有着重要的作用,是近年来表观遗传领域的一项重要突破。
DNA甲基化是植物和哺乳动物中最主要的表观遗传修饰之一。作为基因组自然发生的共价修饰之一,DNA甲基化是植物和哺乳动物正常生长发育所必需的,它广泛参与转录抑制、转座子沉默、细胞发育与分化调节、基因组印迹、X染色体失活、重编程等过程。在植物中,DNA主动去甲基化过程是通过ROS1家族介导的碱基切除修复机制来实现的。朱健康研究组以往的研究发现,组蛋白乙酰化酶IDM1能识别多个表观遗传学的标志,并对相应位点的组蛋白进行乙酰化,从而改变这个特定区域的染色体的结构,使得ROS1对这个区域的DNA进行去甲基化(Qian et al., Science,2012)。
在这项新的研究中,研究人员发现拟南芥MBD7和IDM3是阻止基因表达抑制和DNA高度甲基化的抗沉默因子。MBD7结合到CpG高度甲基化的区域,并与其他的抗沉默因子(包括组蛋白乙酰转移酶IDM1以及α晶状体结构域蛋白IDM2和IDM3)形成抗沉默复合体。以往的研究证实,IDM1和IDM2可通过5-甲基胞嘧啶DNA糖基化酶/裂解酶ROS1来促进DNA主动去甲基化(Qian et al., Mol. Cell,2014)。因此,MBD7通过将三个IDM蛋白招募到甲基化DNA上形成复合体,促使DNA去甲基化酶发挥功能,转而限制了DNA高度甲基化并阻止了转录水平的基因沉默。
这项研究发现了第一个抗沉默蛋白复合体,进一步解析了植物去甲基化的调控机制。
该系列工作得到中科院等的资助。(来源:中科院上海生科院)
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