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明升体育app家建成最完整明升m88树 |
涵盖230万个物种 |
这个明升m88之树的循环视图并不包括所有的提示,只是500多种与其相关的分支。
图片来源:OpenTreeofLife.org
想知道自己与一条鲸鱼有什么关系吗?或是一只变形虫?现在你终于可以实现这个愿望了,这多亏新发布的“开放明升m88之树”,它将超过500类不同生物体的系谱图编织在一起,从而创造了一棵涵盖230万个物种的“超级树”。
研究人员已经开始用这些新的数据更好地理解地球上的明升m88。并未参与该数据库建设的英国伦敦帝国学院计算生物学家James Rosindell指出:“我们在生物学中研究的任何事物都能够在这棵明升m88之树上找到自己的位置。”他说:“这是非常重要的,明升体育app家终于制造出了一棵完整的树。”
在过去的3年中,来自11个美国实验室的35位研究人员,花费了约10万小时对系谱图的明升体育app文献进行了提炼。他们不得不解决命名的问题——有时一个物种会有多个名称,而且一度一只针鼹与一条海鳗共享相同的名字,从而使计算机产生了混淆。这项研究的合著者、盖恩斯维尔市佛罗里达大学进化生物学家Douglas Soltis表示:“如果没有被数据库接受的名称,研究人员将不得不想出一个新的名称。”
Soltis和他的同事曾以为将这些不同的系谱图整合在一起——它们通常都是不一致的——将是最困难的工作。然而真正让研究人员感到头疼的却是缺乏数字化的数据。
在2000年至2012年间发表的7500棵家族树中,只有六分之一是经过电脑处理的。帮助协调这项工作的北卡罗来纳州达拉莫市杜克大学进化生物学家Karen Cranston说,最终研究人员使用约500棵小树构建了一棵大树。Cranston表示,日前在美国网络版上发表的草图树具有相对较小的样本量,“并不能概括我们所知道的全部信息”。
但Cranston强调,这一家族树的网站包含了能够检索到原始研究的链接,从而为研究人员提供了更多选择。此外,这个网站将能够接受用户的反馈并纳入新的数据,这些最终将被用于更新家族树。Cranston说:“我们希望这棵树在1年后看起来会非常不同。”
与此同时,Rosindell与牛津大学自然历史博物馆进化生物学家Yan Wong已经改进了之前由他们研发的一个计算机工具,从而帮助人们“看清”这棵树。
这个所谓的OneZoom工具就像谷歌地图一样,用户可以向下钻取一棵树的树干、树枝和尖端,从而看到更精细的细节。在一个视频中,OneZoom工具从对一棵树的概述出发,然后放大到越来越细致的分支,从而过渡到最早的动物,然后是有胎盘的哺乳动物,最后是人类。
对于这棵树,Wong使用的不仅是“开放明升m88之树”的数据,而且还有其他他认定为重要研究中的数据。
“开放明升m88之树”协调人、安阿伯市密歇根大学进化生物学家Stephen Smith表示:“这是一个很酷的可视化工具。”他希望有更多的数据能够得到修改。如果你能把它和其他数据结合起来,例如,“你可以建造自己的明升m88之树”。(来源:明升官网明升体育app报 赵熙熙)