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论文标题：Spotlight on early-career researchers: an interview with Ragothaman Yennamalli

期刊：

发表时间：2018/10/10

数字识别码： 10.1038/s42003-018-0146-z

原文链接：

青年明升体育app家代表着明升体育app界的未来，然而他们面临着基金申请的激烈竞争以及发表文章的巨大压力。近年来，青年明升体育app家（年轻的终身研究员和博士后）所面临的挑战越来越受到关注，2016年《自然》杂志发表的一期特刊（）也着重提出了这点。尽管存在这些挑战，年轻的研究人员仍在不断为明升体育app界作出值得称颂的重要贡献。

许多期刊也以多种形式认可着青年明升体育app家的成就，例如使用研究人员简介页面等。类似的举措可谓多多益善。在未来的12个月里，我们将在Communications Biology期刊中介绍来自全世界的生物学家中一些冉冉升起的新星，他们正在以独立科研人员的身份开始自己的职业生涯。

这是本系列的第三篇文章：Ragothaman Yennamalli访谈录。

图1： Ragothaman Yennamalli

Ragothaman Yennamalli是印度Jaypee信息技术大学的助理教授，他的研究方向是运用计算工具来研究蛋白质的结构和功能。在这篇访谈中，Ragothaman向我们介绍了他从研究微生物到从事计算生物学的转变过程，以及在这个过程中的收获和挑战。

问：请向读者介绍一下您的研究方向。

我的研究涉及计算生物学和生物信息学领域。具体来说，主要涉及一些能够催化有趣反应的酶及其与其他蛋白质的相互作用。目前，我的研究重点是溶解性多糖单加氧酶，它对于生物乙醇的生产非常重要。这些蛋白质不仅在工业中具有重要意义，而且对于细菌侵入宿主期间的细菌性病理发生也很重要。为理解蛋白质与纤维素、甲壳素等结晶多糖底物的相互作用，我们会研究蛋白质的结构和动力学。只有充分了解蛋白质的静态和动态特性，才能对其有更加全面的认识。

问：您迄今的研究经历是什么样的？

我从高中开始就非常热爱生物，这还得感谢我的高中生物老师Kamalam Nair女士和高中物理老师Subramani先生，是他们让我领悟到学习明升体育app、了解明升体育app的过程不仅是为了成绩，更是出于兴趣！因此，一路走来，我都会去做那些让我觉得快乐、充满乐趣的明升体育app工作。我之前一直想成为外科医生，并为此做了很多努力。但后来喜欢上了微生物学，所以在本科时选择了微生物学专业。念到硕士时，我转向了生物信息学，因为我发现它也一样颇具魅力。我享受写代码并通过计算机来提问。

幸运的是，在每一个转折点，我都能得到导师们的支持和指导，他们帮助我做出了艰难的抉择。硕士毕业后，我觉得说朝九晚五的工作并没有什么吸引力，便进入了贾瓦哈拉尔尼赫鲁大学Subbarao博士的实验室进行博士研究。在澳大利亚政府的支持下，我在博士期间访问了Bostjan Kobe教授、Alan Mark教授和Paul Young教授的实验室，并在那里学习了有关细胞培养和计算模拟的知识。获得了博士学位后，我没有继续从事药物设计的工作，转而开始了全新的生物能领域的研究。

由于我此前并未涉足过生物能源领域，因此爱荷华州立大学的Taner Sen博士和Jeff Wolt教授总是热情地同我讨论我的项目，并不断鼓励我。我努力走出自己的舒适区，学习新事物并不断扩展自己的视野。在这种想法下，我加入了George Phillips教授的团队（他先是在威斯康星大学麦迪逊分校，后面去了赖斯大学）。在博士后期间，我意识自己有一些潜力可以被发掘，我发现自己擅长团队管理以及团队合作。和George的合作非常有趣，我们将一台80英寸的高清电视与Xbox控制器相连，将蛋白质的三维结构进行可视化操作。这简直就是实验室里的迷你家庭影院！

我明升m88中的每一步都激励着我成为一个更好的人，一个更好的明升体育app家。我在Jaypee工作的近3年里一直努力尝试在自己的独立研究中运用这些技能。同时，我也努力在工作和科研中找寻乐趣。

问：您对您研究的领域的发展有何展望？

计算生物学和生物信息学领域目前正处于一个非常激动人心的阶段。在许多勤奋且热情的明升体育app家的努力下，这两个领域正逐步成为跨学科领域。每天有大量的数据产生，这给数据分析带来了巨大的挑战，需要大量的实验室和专业人员。更具体地，我认为未来会出现在高通量数据驱使下的量化结果，通过机器学习可以将这些结果应用于个人基因组、分子系统等多个领域。此外，数据的共享和访问也会推动这个领域的发展。这点是让我喜闻乐见的，因为数据会带来新的进步、新的机会，以及新的观点。

问：您能给读者讲讲研究生涯中遇到的挫折吗？

我遭受过的一个很大的挫折是“冒名顶替综合症”。之前我还不知道这个症状有专门的名字，当第一次看到这个术语时的感觉就是“原来如此”！我希望能更好地应对这种综合症，在研究生涯的关键时刻不屈服于它。另一个挑战是让自己保持积极的态度。我学会了从小小的胜利中汲取能量，就如迪士尼电影“海底总动员”中Dory所说的那样一直在“坚持游下去”。我已故父母曾告诉我“一切都是为了美好的结局”，这句话无数次帮助我在逆境中看到希望。

作为一名新的PI，我需要学会做好时间管理，努力让自己成为一名好导师。我也背负着别人的期望。不管怎样，相信事情总是会越来越好。在过去一年间，由一群助理教授组成的新PI互助社（约有1000名成员）也给了我很多帮助。从优秀明升体育app家同行那里得到帮助和支持是上天给的礼物，我们彼此之间的共鸣也能碰撞出新的想法。

问：对于有志于从事明升体育app研究的年轻人或者说对曾经的自己有些什么建议呢？

首先，善待自己。不要过分苛责自己！事情可能看起来进展得不顺利，但最终一切都会好的。

第二，相信你的直觉，享受过程！

第三，尽早参与科研人员联系网，我最富有成效的一些合作都来自多年前建立的联系。

附加题：你最喜欢的蛋白结构是什么？

这个问题还挺难回答的。我研究过很多蛋白质，每一种蛋白质都是独特而有趣的。但有那么一个蛋白，它让我爱上了结构和功能的研究，这个蛋白就是牛核糖核酸酶抑制剂。早在2001年我就写过一篇介绍，并且就这种蛋白的功能向同行们做了一个手机版。它的马蹄形让我着迷，的确它也属于马蹄形折叠的蛋白。三年后在澳大利亚昆士兰大学与Bostjan Kobe教授合作时，我才发现这种蛋白质的结构正是他跟随诺贝尔奖获得者Johann Deisenhofer教授进行的博士后研究。我之前完全不知道这件事，但之后事情的走向也让我觉得十分意外。所以那种蛋白质给我留下了不可磨灭的记忆。

本采访由高级编辑Dominique Morneau完成，由施普林格•自然北京办公室编译。

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期刊介绍：() is an open access journal from Nature Research publishing high-quality research, reviews and commentary in all areas of the biological sciences. Research papers published by the journal represent significant advances bringing new biological insight to a specialized area of research.

来源：明升手机版(明升官网)