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作者:刘龙奇等 来源:《细胞》 发布时间:2024/8/28 10:24:28
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时空组学技术助力生物学和明升手机版发展

 

一直以来,明升体育app家们努力解读由30亿碱基对组成的明升m88“天书”。随着细胞组学向时空组学的全面突破,人们可以在时间和空间的维度上,清晰地看到身体每个细胞的全景特征,为理解基因组“天书”以及生物学和明升手机版研究带来新机遇。

8月22日,《细胞》刊发了华大明升m88明升体育app研究院团队的综述文章。该文章系统阐述了时空组学技术如何帮助理解人类基因组、推动生物学认知和明升手机版变革。

论文截图

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明升m88“中心法则”向“时空法则”迈进

1958年,英国明升体育app家弗朗西斯·克里克首次提出明升m88“中心法则”,揭示了DNA中的遗传信息如何流动,这是遗传、变异、演化和适应背后的生物学基础。在此基础上,人类基因组计划解析了人类遗传密码的30亿个DNA碱基对和大约25000个基因,开启了研究遗传信息如何决定生物功能的新时代。

然而,即使知道了这30亿个碱基对,明升体育app家们却依旧不能完整地理解基因组。如何将时间和空间因素加入考虑范畴,从中心法则推演到明升m88的时空规律?

测序技术的进步使大规模多组学解析成为可能,它可以分析组织水平上的遗传信息表达调控异质性,但无法完全揭示组织内不同细胞类型的异质性。细胞组学能够精确分析单个细胞内的遗传信息,在多个维度上定义细胞类型和状态,但缺乏位置信息。

该文章提出,时空组学技术的发展,使人们能够全面解析细胞组成、定位、细胞间相互作用和细胞微环境的在时空动态。

时空组学技术总体可以分成两大类,即基于成像的方法和基于测序的方法。基于测序的时空转录组学技术能够进行全基因组范围的分析,从早期的微米级分辨率技术,进一步发展成为纳米级分辨率技术。

尽管转录组显著提升了研究者对基因表达和调控的理解,但也仅是单层信息。时空组学在其他组学检测方面相关的技术在不断出现。在时间分辨率方向,虽然目前的时空研究主要限于连续采样,为细胞分化和发育的精确追踪提供了可能。

“当然,时空组学技术仍面临挑战,未来的技术发展应朝着更高的空间精度、多维度分析、以及更好的可及性方向努力。”论文第一作者、华大明升m88明升体育app研究院细胞组学领域首席明升体育app家刘龙奇表示。

探索明升m88明升体育app的“GPS”系统

时空组学就像一个强大的“明升m88GPS系统”,揭示明升m88运作的时空动态背后的机制。时空组学数据的分析不仅是分析细胞类型异质性,还需要准确定位细胞的时空特征,从而扩大输入信号的维度和模式,映射出从细胞分布到细胞间连接、通讯和细胞形态等全景、动态信息。

通过时空组学,明升体育app家们能够以前所未有的精度绘制出各种器官内的基因特征、细胞类型、密度及其互作关系,为理解器官结构和功能提供数据支撑;可以解析包括大脑、心脏、肠道等发育中的器官,以及包括人类、小鼠、斑马鱼和果蝇在内的多种物种胚胎的时空动态,寻找发育和再生过程的奥秘;还能提供比基因组和细胞组学更详细的组织结构层面的证据,助力研究明升m88演化的时空规律。此外,时空组学也为研究疾病的发生、发展和治疗提供了全新的视角。

在临床方面,时空组学还将推动临床病理的变革,特别体现在高异质性疾病的分型、个性化治疗和预后的方案制定方面。对于未分化肿瘤和原发灶不明的癌症,与过去单一标记检测方法相比,空间组学分析方法提供了更高的诊断敏感性和准确性。未来,结合时空组学和AI算法,将实现临床病理诊断的新变革。

2022年,时空组学联盟成立,旨在通过联合全球明升体育app家的力量,基于大规模的时空多组学分析,在器官图谱、发育与衰老、人类疾病和明升m88演化四大方向上加速人们对生物学过程的理解。该文章指出,为了更好地推动时空组学大明升体育app计划,需考虑组建跨学科团队,建立全球多中心组学平台和数据协作组,以及成立标准协作组。

“时空组学将极大推动我们对生物过程的细胞和分子基础的理解。同时,人工智能和计算生物学的快速进展将显著推动细胞图谱数据、成像和临床表型数据与AI算法的整合。这一整合将大大推动疾病诊断、治疗和预后方法的进步,加速精准明升手机版的临床应用。”论文通讯作者、华大明升m88明升体育app研究院院长徐讯表示。(来源:明升官网明升体育app报 刁雯蕙)

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