7月5日,上海师范大学明升m88明升体育app学院教授黄学辉团队与合作者创制了大规模的水稻“混血杂交”群体,开创了一系列遗传学大数据分析新方法,大幅提升了农艺性状遗传解析的效率,为水稻新品种的设计培育提供了基因信息和理论支持。相关研究发表于《明升体育app》。
图片由课题组提供
各类复杂农艺性状由哪些基因决定、如何高效解析、基因之间有何联系,一直以来都是水稻等作物遗传研究的基本问题,也是实现水稻智能化育种的重要理论基础。
研究团队分析筛选出涵盖水稻全类群的16份品系,并通过巢式群体设计对代表性材料进行杂交。在此基础上,研究人员通过多代自交生成了稳定纯合的株系,最终形成了包含18421份纯合“混血杂交”株系的新型群体。
针对各类水稻育种性状,研究团队鉴定得到了1207个基因位点,每个性状平均可以检测出27.5个基因位点,并系统解析了水稻基因的遗传互作网络,大幅提升了遗传定位的功效和分辨率。
进一步地,研究团队综合利用亲本间基因变异、每套子群体的定位结果、基因表达、同源基因功能等多组学信息,开发了可用于从遗传位点快速筛选到候选基因的方法RiceG2G,并对两个新鉴定的基因进行了功能验证。
研究团队介绍,这项研究涉及农学、生物学、信息学、统计学等多个学科,多学科的交叉融合为研究的顺利推进注入了重要力量。
相关论文信息:http://doi.org/10.1126/science.adm8762
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